Quantification de l'expression genetique

Quantification of gene expression

Abstract

L'invention concerne un procédé permettant de mesurer la quantité d'un acide nucléique cible dans un échantillon au moyen d'un étalon qui est conçu de manière à présenter une différence de base, comparée avec le gène considéré ou une « séquence acide nucléique cible ». L'utilisation d'un tel étalon, en combinaison avec un procédé d' « accroissement » de la différence dans l'étalon et l'échantillon d'acide nucléique à tester, au moyen, par exemple, d'une réaction d'extension de base effectuée directement sur le site de mutation, permet l'amplification de l'étalon et des acides nucléiques cibles avec la même efficacité et facilite la quantification de l'acide nucléique cible. De la sorte, un moyen de quantification de l'étalon « augmenté » et des échantillons d'acide nucléique cible est utilisé pour déterminer la quantité de l'acide nucléique cible. Selon une forme d'exécution préférée, le moyen de quantification est la spectrométrie de masse.
The present invention relates to a method for measuring the amount of a target nucleic acid in a sample using a standard which is designed to have one base difference compared with the gene of interest or a 'target nucleic acid sequence.' Use of such standard in combination with a method of 'enhancing' the difference in the standard and the test nucleic acid sample using, for example, a base extension reaction carried right at the mutation site allowing amplification of the standard and target nucleic acids with the same efficiency and facilitating quantification of the target nucleic acid. Thereafter a means of quantifying the 'enhanced' standard and target nucleic acid samples is used to determine the amount of the target nucleic acid. In the preferred embodiment, the quantification means is Mass Spectrometry.

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Patent Citations (4)

    Publication numberPublication dateAssigneeTitle
    US-6268147-B1July 31, 2001Kenneth Loren Beattie, Rogelio Maldonado RodriguezNucleic acid analysis using sequence-targeted tandem hybridization
    US-6297017-B1October 02, 2001Brax Group LimitedCategorising nucleic acids
    US-6387629-B1May 14, 2002Reprogen, Inc.Use of cathepsin S in the diagnosis and treatment of endometriosis
    US-6558902-B1May 06, 2003Sequenom, Inc.Infrared matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometric analysis of macromolecules

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    See also references of EP 1546385A2

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